В центре сюжета детективного триллера "Наследие доктора Смерть: Чёрный файл" находятся два опытных детектива — Хаято Инукай и Асука Такатиро. Они погружаются в расследование серии загадочных смертей, которые произошли в их городе. Все жертвы страдали от неизлечимых заболеваний и, казалось, нашли утешение в последнем пути. Однако за каждым случаем скрываются мрачные обстоятельства, и детективы начинают подозревать, что за этим стоит некий человек, известный как доктор Смерть, который предлагает эвтаназию по просьбе пациентов.
Ситуация осложняется, когда дочь Хаято, Саяка, также оказывается на грани жизни и смерти из-за тяжелого заболевания почек. В отчаянии она обращается за помощью к доктору Смерть, что ставит Хаято перед непростым выбором — следовать заветам закона или спасти свою любимую дочь. В ходе расследования детективы сталкиваются с моральными дилеммами, которые заставляют их сомневаться в правильности своих действий. Чем глубже они погружаются в мир доктора Смерть, тем яснее становится, что эта история не только о жизни и смерти, но и о любви, утрате и поисках справедливости в мире, где границы между добром и злом размыты.
