В центре сюжета фильма «Приют. Шепот призраков» оказывается новая воспитательница, которая приезжает в заброшенный детский приют вместе со своей младшей сестрой. С первых дней пребывания в этом мрачном месте, девочки начинают ощущать странные и пугающие явления — шепоты и тени, которые напоминают о трагических событиях, произошедших здесь десять лет назад. В приюте погибли несколько детей, и их души не нашли покоя.
Ситуация осложняется тем, что дух мстительной главы приюта, обвиненной в гибели детей, начинает преследовать девушек, не желая оставить свои тайны в прошлом. Чтобы успокоить призраков и освободить это место от зловещих сил, воспитательнице и её сестре предстоит провести собственное расследование. Им придется разгадать загадку трагедии, восстановить цепь событий, которые привели к гибели детей, и узнать правду о том, что на самом деле произошло в этом страшном месте. С каждой новой подсказкой девушки всё глубже погружаются в атмосферу страха и отчаяния, и вскоре понимают, что их жизни также находятся под угрозой.
