Джонатан Ансельм, молодой и амбициозный философ, получает неожиданное предложение от Бема, друга его приемных родителей. Бем просит его проследить за миграцией аистов и попытаться выяснить, почему несколько сотен окольцованных птиц не вернулись в Европу. За день до отъезда Джонатан находит Бема мертвым, и это событие вызывает у него тревогу. Смерть орнитолога выглядит подозрительно, и, несмотря на свои опасения, Джонатан решает продолжить путешествие, полагая, что его исследование может пролить свет на загадку исчезнувших аистов.
По мере продвижения по маршруту, Джонатан сталкивается с множеством трудностей и неожиданными открытиями. Он начинает осознавать, что его поездка не только о птицах, но и о тайнах, которые могут угрожать его жизни. В процессе исследования он встречает различных персонажей, каждый из которых вносит свою лепту в разгадку загадки. Джонатан осознает, что его философские размышления о природе, жизни и смерти становятся частью более широкой картины, в которой переплетаются экология, человеческие судьбы и древние мифы. Его путешествие становится не просто научным, но и личным поиском смысла, в котором он должен разобраться не только с исчезновением аистов, но и с вопросами о своем собственном месте в этом мире.