В центре сюжета сериала "Операция 'Кукловод'" находится Иван Королёв, майор оперативной службы ФСБ, который после неудачной операции по захвату оружейного барона оказывается в плену обстоятельств. Получив серьезное ранение, он принимает решение оставить рискованную работу на передовой и перейти в спецотдел, занимающийся аналитическими разработками. Однако, как показывает практика, спокойная жизнь — это лишь иллюзия. В новом отделе Королёв быстро понимает, что его аналитические навыки будут востребованы как никогда. Вместе с командой коллег он оказывается втянут в сложные интриги, связанные с многоходовой игрой их заклятого врага Перецкого, который снова активизировался и угрожает безопасности страны. Каждый новый шаг Королёва — это не только анализ, но и борьба с тёмными силами, стоящими за преступными схемами. Сериал сочетает в себе элементы триллера, драмы и шпионского жанра, погружая зрителей в мир секретных операций и опасных противостояний.