«Мегамозг» — это история о самом гениальном и одновременно самом неудачливом злодее в мире. На протяжении многих лет он пытался завоевать Метро-Сити, используя самые разнообразные хитроумные планы. Однако каждый его замысел разбивался о супергероя Метро-Мэна, который всегда оказывался на шаг впереди. Но однажды судьба повернулась к Мегамозгу лицом: он устраняет своего заклятого врага. Внезапно злодей оказывается без цели в жизни — у него больше нет противника, с которым можно было бы вести борьбу.
Оказавшись в бездне отчаяния, Мегамозг решает создать нового супергероя, которого называет Титаном. Однако Титан, обладая невероятными силами, решает, что быть злодеем гораздо интереснее, и вместо того, чтобы защищать город, он намеревается его уничтожить. Перед Мегамозгом встаёт непростой выбор: сможет ли он, будучи злодеем, стать героем и спасти человечество от созданного им же чудовища? В этой увлекательной истории переплетаются комедия, экшн и философские размышления о добре и зле, а также о том, как легко можно потерять себя в поисках признания и смысла жизни.