На протяжении многих лет жители небольшого радиационного острова в Тихом океане поклонялись своему божеству — гигантской бабочке Мотре. Они верили, что из её огромного яйца, ставшего символом надежды, должна была вылупиться новая Мотра, которая принесет им защиту и благополучие. Эта традиция прерывалась, когда на остров обрушился мощный тайфун, смывший яйцо в океан. Оно выбросило на берег Японии, где его обнаружила команда рыбаков.
Когда Мотра в сопровождении своих двух фей-хранительниц обратилась к людям с просьбой вернуть яйцо, они отказали ей. Яйцо стало объектом интереса крупной корпорации, которая намеревалась превратить его в прибыльный аттракцион для туристов. Однако вскоре после этого на страну вновь обрушилась угроза в лице Годзиллы. Под давлением катастрофы люди осознали свою ошибку и обратились к Мотре с просьбой о помощи. Теперь им предстояло сделать выбор между алчностью и спасением, осознав, что лишь Мотра может защитить их от разрушительного гнева Годзиллы. В этой борьбе за выживание им нужно было вспомнить о своих корнях и истинной природе божества, которому они когда-то поклонялись.