В Японии разразилась настоящая катастрофа: высокоинтеллектуальные паразиты, способные овладевать человеческими телами, начали охоту на людей. Эти существа проникают в мозг своих жертв, поглощая их сознание и беря под контроль тело, чтобы удовлетворить свои хищные инстинкты. Однако среди общего хаоса есть один парень, которому повезло больше остальных — старшеклассник Синъити Идзуми. Паразит, который попытался захватить его, не смог пробраться в мозг, и вместо этого поселился в его правой руке.
Синъити вынужден научиться жить с незваным соседом, получившим имя Миги. Несмотря на сложные обстоятельства, их необычное соседство приносит некоторые преимущества: Миги наделяет Синъити особыми способностями и помогает ему выжить в этом новом, опасном мире. Однако вскоре Синъити сталкивается с другими паразитами, которые не останавливаются ни перед чем ради своей пищи. Перед ним встает сложный выбор: на чьей стороне он окажется в этой борьбе за выживание — людей или паразитов? В этом захватывающем сюжете «Паразит: Часть 1» переплетаются элементы ужасов, драмы и философских размышлений о природе человечества.