В центре сюжета "Тень якудза" оказывается жестокое убийство губернатора Токио, которое потрясает всю Японию. Вскоре после этого похищают сестру его жены, и общественность начинает подозревать, что к этому делу причастна якудза – таинственная и безжалостная японская мафия, известная своими жестокими методами и строгими кодексами чести. Якудза, живущая по законам самураев, не прощает предательства и не терпит слабости, а расправа с врагами неизбежна и беспощадна.
На фоне растущего хаоса и страха, на арену выходит агент ЦРУ Трэвис Хантер. Он осознает, что бросить вызов якудза – это фактически подписать себе смертный приговор, но его стремление к справедливости и желание раскрыть правду сильнее страха. Хантер начинает опасное расследование, полное интриг и неожиданных поворотов. По мере продвижения к истине ему открываются шокирующие тайны, которые ставят под сомнение все, что он знал о якудза, о своих союзниках и даже о самом себе. В этой игре на выживание каждая ошибка может стоить жизни, и Трэвис должен быть готов к любым последствиям, чтобы спасти невинную жертву и остановить безжалостное зло.