В центре сюжета сериала «Садовник» находится история о маньяке-убийце, вдохновленная реальными событиями, связанными с Битцевским маньяком. В условиях напряженной обстановки в Федеральной Службе, высокое руководство Министерства внутренних дел решает оставить только одно подразделение: либо специализированное МВД, либо экспериментальную Федеральную Экспертную Службу (ФЭС). ФЭС получает задание поймать опасного киллера, и от успешного завершения операции зависит будущее всей службы. Однако, несмотря на все усилия команды, их попытки заканчиваются неудачами, а число жертв продолжает расти.
В это время конкурирующее подразделение неожиданно выходит на след маньяка, создавая дополнительные сложности для ФЭС. Кажется, что служба обречена на провал, но затем происходит неожиданный поворот сюжета: киллер оказывается убит, и все улики указывают на одного из сотрудников ФЭС. Обвиненный в убийстве, он вынужден бежать, а его коллеги сталкиваются с необходимостью защитить свою честь и репутацию. В это время Ромашин, один из ключевых персонажей, подает заявление об увольнении, что ставит под угрозу само существование Федеральной Экспертной Службы. Ситуация накаляется, и борьба за выживание становится не только профессиональной, но и личной.