В процессе распродажи Эйприл наткнулась на уникальный антиквариат — старинный японский скипетр, который, как она надеялась, станет отличным подарком для её друзей-черепашек. Однако вскоре выясняется, что этот скипетр обладает необычными свойствами: он является прообразом машины времени, способной переносить в прошлое. Но есть одна важная деталь — чтобы скипетр заработал, вес путешественников должен быть одинаков с обеих сторон.
Судьба приводит Эйприл в феодальную Японию, в 1603 год, и, конечно же, черепашки не могли оставить её одну в этом опасном времени. Они отправляются за ней, но вместо того, чтобы приземлиться в безопасном храме, оказываются посреди яростного сражения. В хаосе битвы Микеланджело теряет скипетр, и теперь черепашкам предстоит не только спасти свою подругу, но и вернуть артефакт, который может изменить ход истории.
Тем временем, в современном мире тоже не всё спокойно. Друзья должны действовать быстро, чтобы предотвратить катастрофу, и одновременно справляться с последствиями своих путешествий во времени. Ожидает множество захватывающих приключений, неожиданных встреч и испытаний, которые проверят их дружбу и храбрость.