После победы над своим заклятым врагом Шредером, семья черепашек оказалась на грани распада. Каждый из братьев — Леонардо, Микеланджело, Донателло и Рафаэль — столкнулся с внутренними конфликтами и вопросами о своем месте в мире. Однако их сенсей Сплинтер, обеспокоенный тревожной атмосферой в Нью-Йорке, понимает, что им необходимо объединиться. В городе начинает нарастать угроза: техноиндустриалист Максимилиан Уинтерс разрабатывает армию древних монстров, чтобы захватить власть.
Чтобы остановить его, черепашкам предстоит вновь стать командой. Вместе с верными союзниками — Эйприл О'Нил и Кейси Джонсом — они отправляются в опасное путешествие, полное приключений и сражений. Их противник — таинственный клан Фут, который, используя свои ниндзя-навыки, стал инструментом в руках Уинтера. Черепашки-ниндзя должны преодолеть свои разногласия, чтобы не только спасти город, но и восстановить свою семью, ведь только объединившись, они смогут противостоять темным силам, угрожающим их миру. Это будет не просто битва за справедливость, но и путь к восстановлению утерянной связи между братьями.
