Маленькая, но очень любопытная рыбка по имени Поньо — дочь могущественного колдуна и прекрасной морской богини. Её жизнь в подводном мире полна чудес, но Поньо жаждет узнать больше о мире людей. Однажды, отправившись на исследование, она оказывается в ловушке — застревает в банке и оказывается выброшенной на берег. На помощь ей приходит пятилетний мальчик по имени Сосукэ, который находит её и решает спасти. Между ними быстро завязывается дружба, и Поньо, вдохновленная своей новой знакомой, мечтает стать человеком.
С каждым мгновением, проведенным с Сосукэ, её желание становится всё сильнее. Однако для осуществления этой мечты Поньо предстоит преодолеть множество испытаний, ведь мир людей и морских существ полон тайн и опасностей. В их приключениях они сталкиваются с магией, дружбой и самопожертвованием. История Поньо — это не только сказка о превращении, но и о том, как настоящая дружба может изменить судьбы, преодолеть границы и соединить два мира.
