Прошло пять лет с тех пор, как Питер Паркер осознал, что с великой силой приходит великая ответственность. Он оставил жизнь супергероя на три года, наслаждаясь мирной жизнью. Питер отлично учится, Нью-Йорк считает его героем, а его отношения с Мэри Джейн становятся все крепче — он даже планирует сделать ей предложение. Однако его идиллия нарушается, когда лучший друг Гарри Озборн, не смирившийся с потерей отца, начинает подозревать, что именно Человек-паук виновен в его смерти. Вдохновленный местью, Гарри принимает облик Нового Гоблина, готовясь к столкновению с Питером.
Тем временем на улицах Нью-Йорка появляется новый злодей — Песочный Человек, обладающий невероятной силой и способностями. Питер, стремясь справиться с новыми угрозами, находит таинственный черный костюм, который усиливает его силу, но также пробуждает темные, мстительные инстинкты. В борьбе с врагами Питеру предстоит столкнуться с самым опасным противником — самим собой. Как он сможет преодолеть внутренние демоны и восстановить свою истинную сущность? "Человек-паук 3: Враг в отражении" — это история о борьбе с тьмой, которая скрыта внутри каждого из нас.