В центре сюжета "Мистериум: Эффект Марко" оказывается 14-летний мальчик по имени Марко, который неожиданно становится объектом внимания полиции на датской границе. Его задерживают после того, как у него находят паспорт пропавшего без вести чиновника, обвиненного в педофилии много лет назад. Это открытие заставляет полицию вновь обратить внимание на старое дело, которое, казалось бы, давно закрыто. Начальник отдела полиции Карл Мёрк, известный своим упорством и нестандартным подходом к расследованиям, берется за повторное изучение обстоятельств исчезновения чиновника. Он погружается в запутанный мир тайн и лжи, пытаясь выяснить, как паспорт оказался у мальчика и какую роль он сыграл в этой трагической истории. В ходе расследования Мёрк сталкивается с множеством препятствий, включая противостояние со стороны тех, кто предпочел бы оставить прошлое в прошлом. Каждый шаг приближает его к разгадке, но также ставит под угрозу безопасность Марко и его собственную жизнь. Сюжет полон неожиданных поворотов, заставляющих зрителей задаваться вопросами о правде, доверии и том, что на самом деле скрывается за фасадом благополучия.
