Когда Мери Гриффит, глубоко верующая христианка, узнаёт, что её сын Бобби — гей, её мир переворачивается. Для неё это не просто открытие, а настоящая катастрофа, противоречащая всем её религиозным убеждениям. Мери искренне считает, что сексуальная ориентация Бобби — это грех, и она решает, что единственным выходом из этой ситуации может стать усиленная молитва и обращение к Богу. Она убеждена, что через веру и покаяние её сын сможет найти путь к исцелению и восстановлению своей "нормальности". Внутри неё происходит борьба между материнской любовью и религиозными предрассудками, и Мери начинает призывать Бобби молиться больше, посещать церковь и участвовать в различных духовных практиках, надеясь, что это поможет ему изменить свою природу. Однако её действия приводят к конфликтам и непониманию между ними, ставя под угрозу их отношения и вызывая глубокие переживания как у матери, так и у сына. Фильм "Молитва за Бобби" исследует сложные темы любви, принятия и религиозных предрассудков, заставляя зрителей задуматься о том, что значит быть верующим в мире, где любовь и принятие должны стоять на первом месте.