В центре сюжета нового расследования исчезает без вести сотрудница ФБР, и её коллеги оказываются в безвыходной ситуации. В поисках ответов они обращаются к Фоксу Малдеру и Дане Скалли — бывшим специальным агентам, которые по своим причинам оставили службу. Несмотря на то, что их пути разошлись, они решают снова объединить усилия, ведь надежды на успешное расследование тают с каждой минутой.
Ключевую информацию предоставляет им Джозеф Криссман, пожилой человек с темным прошлым: некогда он был священником, но отбывал наказание за преступления против детей. Теперь, находясь на свободе, он утверждает, что зловещие картины преступлений возникают в его сознании «по воле Бога». Его слова вызывают у Малдера и Скалли как надежду, так и сомнения, заставляя их задуматься о границах разума и духовности. Каждый новый шаг в расследовании открывает мрачные тайны, которые связывают исчезновение с давними грехами, и агенты оказываются на грани раскрытия не только преступления, но и глубин человеческой души.